Comment 5 for bug 348216

Para ese caso necesitas decirle a kumbiaphp que no necesitas renderizar la vistas porque sino por defecto el buscara esa vista asociada a la action prueba, entonces necesitas hacer lo siguiente en tu metodo para omitir la vista.

class LoginController extends ApplicationController{
 function prueba(){
  Flash::warning("HOLA");
  $this->render(null);
 }
}

date cuenta del $this->render(null);

No es un Bug del Framework